能夠正確歸集研究開發(fā)費用，是申請高新技術企業(yè)的一個必要條件。在每年匯算清繳期間，《企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構明細表》也是企業(yè)進行稅收優(yōu)惠備案必須向稅務機關報送的資料。在研究開發(fā)費用歸集方面，有一項規(guī)定非常容易被忽視，即委托外部研究開發(fā)費用。

《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》中規(guī)定：委托外部研究開發(fā)費用，是指企業(yè)委托境內(nèi)其他企業(yè)、大學、研究機構、轉(zhuǎn)制院所、技術專業(yè)服務機構和境外機構進行研究開發(fā)活動所發(fā)生的費用(項目成果為企業(yè)擁有，且與企業(yè)的主要經(jīng)營業(yè)務緊密相關)。委托外部研究開發(fā)費用的發(fā)生金額應按照獨立交易原則確定。認定過程中，按照委托外部研究開發(fā)費用發(fā)生額的80%計入研發(fā)費用總額。

《國家稅務總局關于實施高新技術企業(yè)所得稅優(yōu)惠有關問題的通知》中規(guī)定: 企業(yè)在年度納稅申報前向主管稅務機關報送的備案資料的計算、填報口徑參照《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》的有關規(guī)定執(zhí)行。 因此，企業(yè)在年度納稅申報之前，在向稅務機關進行企業(yè)所得稅稅收優(yōu)惠備案時，要上報的《企業(yè)年度研究開發(fā)費用結(jié)構明細表》中，委托外部研究開發(fā)費用也要按照發(fā)生額的80%計入。

此外，有些企業(yè)的研究開發(fā)項目可能不止一項，而《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》中所稱的研究開發(fā)費用總額，并沒有明確是企業(yè)所有項目的研究開發(fā)費用總額還是企業(yè)單個項目的研究開發(fā)費用總額。因此，我們建議，企業(yè)在進行研發(fā)項目預算以及研究開發(fā)費用歸集時，要充分考慮這兩項費用的限額，所有項目的研究開發(fā)費用總額不能超限，單個項目的研究開發(fā)費用總額也最好不要超限，以避免稅務風險。